企業在取得不合規發票時，應采取以下措施進行處理：

1.不得作為稅前扣除憑證：企業取得的不合規發票，如私自印制、偽造、變造、作廢、開票方非法取得、虛開、填寫不規范等，不得作為稅前扣除的憑證。

2.要求補開或換開：如果企業應當取得而未取得發票，或取得的是不合規發票，且支出真實且已實際發生，應在當年度匯算清繳期結束前，要求對方補開或換開發票，以符合規定的發票作為稅前扣除憑證。

3.稅務機關檢查后的補救措施：如果在匯算清繳期結束后，稅務機關發現企業應取得而未取得發票或取得不合規發票，并告知企業，企業應自被告知之日起60日內補開或換開符合規定的發票。如果因對方特殊原因無法補開或換開，企業應提供可以證實其支出真實性的相關資料。

4.追補扣除：對于以前年度的支出，如果因未取得合規憑 ……